適宜條件 有機白靈菇貯藏的最適溫度為-0.5～0.5℃。溫度過高會加快色變或衰老，甚至腐爛;過低又會造成冷害或凍害。貯藏環境的空氣相對濕度以95%～100%為宜。低氧氣或高二氧化碳濃度的環境有利于有機白靈菇的保鮮。
采收要點 當有機白靈菇菌蓋充分展開，孢子未大量釋放時采收。要輕采、輕拿、輕裝，減少機械碰撞與損傷，用利刀削平菇柄，毛刷刷凈菇體雜物，并剔除畸形、破損和帶病蟲的菇。要求菌蓋完整，菌蓋(掌形菇)7～15厘米，菇色潔白，菌肉堅實，柄長不超過2厘米。單個重150克左右時最受市場歡迎，售價也較高。 保鮮劑處理 采后及時用0.01%～0.02%山梨酸鉀、苯甲酸鈉或0.1%～0.5%焦亞硫酸鈉漂洗5～6分鐘。
預冷 將經過分級、修整、處理后的鮮菇放入塑料筐中，及時移入0～1℃的冷庫中充分預冷，一般以15～20小時為宜。 包裝、冷藏 將有機白靈菇用食品紙包裝后，放入內襯聚氯乙烯(PVC)保鮮袋的塑料周轉筐、泡沫箱或紙箱內，扎緊袋口，雙層袋的貯藏效果好于單層袋，每箱以5～10千克為宜。在0℃左右的條件下，可貯藏50～60天，無開傘、發霉、褐變等現象，風味也無明顯變化。
